Každoročně je nutné odstranit nejen biologický odpad ze dna, tedy hlavně listí, které do vody napadalo, ale i to, co tam lidé naházejí. Letos to byly opět sklenice i lahve od piva, ale i elektronické cigarety, dvě několikametrové latě či dudlík.
Při vypouštění vody správci pochytají ryby a převezou je na sádky. Ve strouze jsou oranžoví koi kapři ale i ostroretky, které zbavují vodu zelených řas. Když ve strouze zůstane jen malý potůček na oblázkovém dně, je třeba prohlédnout a opravit pásy při břehu. Při vhodných klimatických podmínkách to může trvat tři až čtyři dny. Teprve poté mohou správci zase Mlýnskou strouhu napustit. Ryby se do ní vrátí, až když má voda vhodné parametry, zejména pH. Pokud se práce vlivem počasí nezpozdí, mohly by ní ozdobní koi kapři znovu plavat ještě před Velikonocemi.