Kariéra Jaroslavy Kunové ve zdravotnictví započala v letech 1991 - 1996, kdy působila na pozici ředitelky Nemocnice s poliklinikou Stod. Na následující dva roky se stala ekonomickou náměstkyní Fakultní nemocnice Plzeň a od roku 1998 byla její ředitelkou. Právě v době jejího "ředitelování" se začala nemocnice dynamicky rozvíjet. Kromě řízení fakultní nemocnice působila Jaroslava Kunová jako dlouholetá předsedkyně Asociace nemocnic ČR.
"Budeme na Jaroslavu Kunovou vzpomínat jako na významnou osobnost Fakultní nemocnice Plzeň, která si svým konstruktivním, a zároveň empatickým jednáním získala uznání široké odborné veřejnosti, pacientů a mnoha zaměstnanců FN Plzeň," uvedla v prohlášení Fakultní nemocnice Plzeň.